应与各种出疹性传染病。病毒感染。急性淋巴结炎。类风湿病以及其它结缔组织病。病毒性心肌炎。风湿炎心脏炎互相鉴别。
　　本症与猩红热不同之点为：①皮疹在发病后第３天才开始；②皮疹形态接近麻疹和多形红斑；③好发年龄是婴幼儿及较小儿童时期；④青霉素无疗效。
　　本症与幼年类风湿病不同之处为：①发热期较短。皮疹较短暂；②手足硬肿。显示常跖潮红；③类风湿因子阴性。
　　与渗出性多形红斑不同之点为：①眼。唇。无脓性分泌物及假膜形成；②皮疹不包括水疱和结痂。
　　与典型结节性动脉周围炎（Ｋｕｓｓｍａｕｌ－Ｍａｉｅｒ型）的症状有很多相似之处。但ＭＣＬＳ的发病率较多。病程产短。预后较好。区别之点如下：①后者的血管炎显示明显的类纤维样坏死（ｆｉｂｒｉｎｏｉｄｅｎｅｃｒｏｓｉｓ）。而ＭＣＬＳ则少见这种坏死性变化或仅有轻微变化；②典型的结节性动脉周围炎难得涉及肺动脉。
　　与系统性红斑狼疮不同之处为：①皮疹在面部不显著；②白细胞总数及血小板一般升高；③抗核抗体阴性。④好发年龄是婴幼儿及男孩多见。
　　与婴儿型结节性多动脉类　　与出疹性病毒感染的不同点为：①唇潮红。干裂。出血。呈杨梅舌；②手足硬肿。常跖潮红及后期出现指趾端膜状脱皮；③眼结膜无水肿或分泌物；④白细胞总数及粒细胞百分数均增高。伴核左移；⑥血沉及Ｃ反应蛋白均显著增高。
　　与急性淋巴结炎不同之点为：①颈淋巴结肿大及压痛较轻。局部皮肤及皮下组织无红肿；②无化脓病灶。
　　与病毒性心肌炎不同之处为：①冠状动脉病变突出；②特征性手足改变；③高热持续不退。
　　与风湿性心脏炎不同之处为：①冠状动脉病变突出；②无有意义的心脏杂音；③发病年龄以婴幼儿为主。