1.睑内翻及倒睫：在沙眼的后期。病变可侵及睑板。因瘢痕组织收缩而变短。加之睑结膜。特别是睑板上沟部位因瘢痕而收缩。遂使睑板向内弯曲如舟状。形成典型的睑内翻倒睫。倒睫亦可单独发生。乃由于毛囊附近受病变侵犯后产生的瘢痕所致。倒睫的长期刺激。可使角膜浅层呈现弥漫性点状浸润。继而上皮剥脱,形成溃疡。称沙眼性角膜炎或沙眼性角膜溃疡。此时病人异物感。怕光。流泪。疼痛。及视力模糊等症状。应及时作内翻矫正及电解倒睫术。以免造成严重的损伤。

　　2.沙眼性角膜溃疡：在血管翳的末端有灰白色点状浸润。一旦破溃。即形成浅层溃疡。这些溃疡可以互相融合。形成小沟状溃疡。这种由沙眼血管翳所引起的溃疡。与倒睫所引起者。均称为沙眼性角膜溃疡。前者以用药物治疗为主。后者应做手术矫正睑内翻倒睫。

　　3.上睑下垂：由于上睑结膜及睑板组织增生肥厚。使上睑重量增加；同时病变侵及苗勒氏肌和提上睑肌。使提睑功能减弱。因而发生上睑下垂。治疗仍以沙眼为主。

　　4.沙眼性眼干燥症：由于结膜表面瘢痕化。将结膜的付泪腺及杯状细胞完全破坏。泪腺排泄管在上穹窿部的开口也被封闭。粘液和泪液完全消失。结膜及角膜变干燥。严重时结膜角膜呈弥漫性实质性混浊。上皮角化。肥厚。形似皮肤。视力极度降低。此时应点鱼肝油或人工泪液（含有甲基纤维素methylcellutose）以减轻结膜。角膜干燥。或行泪小点封闭术。以减少泪液的流出。

　　5.泪道阻塞及慢性泪囊炎。沙眼衣原体侵犯粘膜。可引起泪小管阻塞。或鼻泪管阻塞。进而形成慢性泪囊炎。